Il Centro Vajrapani (affiliato all'UBI dal 1997) nasce nel 1994 su iniziativa di 7 soci fondatori ed il consenso del Ven. Ghesce Ciampa Ghiatzo, sua guida spirituale, fin dall'inizio delle attività.
Essendo nato come associazione per la pratica della tradizione tibetana, verso la fine del 1998 un nuovo evento caratterizza la storia del Centro: alcuni dei suoi frequentatori (tra cui un socio fondatore), abbracciano la pratica Zen, con particolare riferimento alla tradizione coreana (Soen).
Lo sforzo unanime ha fatto sì che tale avvenimento non abbia portato ad una divisione nel Sangha del Centro Vajrapani ma, al contrario, ha permesso un ulteriore sviluppo dell'associazione. La pratica Ch'an fu infatti integrata nelle attività del Centro con l'accordo del Ven. Ghesce Ciampa Ghiatzo e la guida del Maestro Tae Hye sunim, ed attualmente fa del Centro Vajrapani uno dei pochi centri buddisti italiani in cui si integrino diverse tradizioni buddiste.